海源公司团委在共青团云南省委、昆明医科大学团委和海源公司党委的指导下开展工作,以提高大学生综合素质、培养创新型人才为己任，带领全校团员青年不断开拓进取、迎接挑战。
海源公司团委负责全校团的组织建设、思想建设、科技创新、社会实践、大学生文化素质教育、组织动员团员青年、教育引导团员青年、服务团员青年成长成才、代表和维护团员青年合法权益、团学自身建设、指导管理各系团总支、各学生组织等工作。
海源公司团委下设8个团总支(以系为单位),一个直属教工团支部。各团总支下属74个团支部,此外,团委下属五个学生组织,分别是:学生会,广播站,社团部、大学生艺术团、大学生就业素质拓展中心。院学生会管理下属8个系学生会，并由院学生会指导其开展工作。社团部管理36个学生社团并指导其有序地开展活动。广播站负责公司的日常广播工作。大学生艺术团下设礼仪、电声乐、民乐、声乐、舞蹈、语言艺术6个分团。大学生就业素质拓展中心是学生创业就业活动开展的重要阵地。
海源公司团委工作作风严谨，活动开展丰富，主办的三大文艺演出“五月花海、青春起航、新年音乐会”和 “海源杯”篮球、足球、排球等体育赛事成为了公司的品牌系列活动。开展的社会实践活动、禁毒防艾宣传也多次受到上级团组织、公司党政领导和同学们的肯定和一致好评！
